Построены в 1748 году. «Святыми» Северные ворота Софийского двора были названы, потому как чрез них каждый год проносилась чудотворная икона Божьей Матери Абалакской «Знамение». С движение иконы связано одно из чудес. Летом 1665 г. непрерывно шли дожди, погибали посевы, прибывала в реках вода, все грозило голодом. Тогда из Абалака принесли чудотворную икону. Сам архиепископ Корнилий отслужил литургию, после которой небо просветлело, а дождь прекратился. В честь этого события было установлено ежегодное принесение иконы в Тобольск. Приносилась икона в город в Прокопьев день (21 июля) и до Ильина дня (2 августа) находилась в Тобольске.